情报组的林峰一直暗中调查，却发现好友苗侨伟竟然就是黑警，最终正义的他带着手足围捕苗侨伟。而苗侨伟无奈成为黑警之后，也知道自己无法回头，然而他又没法下手杀死调查他的林峰，最终被林峰射杀，死在好兄弟手下。而同样是黑警的郭政鸿，最终也在围捕过程中被射杀。遭遇打毒针和轮奸而变成毒后的徐子珊，最终心灰意冷，假意攻击警方，被警方击中多枪而身亡。结局最好的要数官恩娜，她在最后的围捕中为一直暗恋的林峰挡子弹，大难不死之后更和林峰发展成为情侣。

雷霆扫毒的大结局：

哥伦比亚毒贩到达货仓，但却没有看见学礼出现。另一方面，世乐亦顺利夺得武器潜入货仓。Johnny没法联络到学礼，只好要各人上救护车，向荣仍在犹豫应否把引爆器按下时，世乐却看到向荣，更要求向荣停手。这时救护车突然发生爆炸，世乐以为是向荣引爆於是对他开枪，向荣受伤倒地，这时学礼却突然出现把向荣带走。学礼扶向荣到货仓的另一边时，向荣竟向学礼拔枪相向。

三人持枪僵持不下学礼对向荣说出自己计划後，世乐亦已追到。世乐因看见救护车被炸，认为家碧已死而激动不已，世乐责怪向荣引爆炸弹，但向荣百词莫辩。失去理智的世乐开枪射击向荣与学礼，三人混战。学礼见世乐仍愤怒激动，即再次挑拨离间，希望世乐与向荣自相残杀，以洩自己一直以来对两人的仇恨。

世乐中计，忍不住对向荣开枪，向荣中枪倒地，奄奄一息。世乐发现毒品藏处咏彤与众警员得希璇通知，大举赶至货仓，学礼寡不敌众走上载满大量蒸馏水的货车逃走。希璇与世乐穷追不舍，终令学礼弃车逃亡。

世乐没找到学礼的行踪，却发现了学礼收藏毒品的秘密。世乐与希璇为迫学礼现身，不停开枪射击装有毒品的蒸馏水，学礼见一切，只恨得咬牙切齿。学礼明白警方支援已到无法抗衡，只好悻悻然潜逃。家碧大难不死却昏迷不醒，希璇特意到探望家碧，更在她面前诉说自己的心底话。学礼逃亡　警方围捕瑞麒等人收到学礼要潜逃离港的线报，於是安排了拘捕学礼的行动。

当警方看见学礼在码头现身时，瑞麒未有在他登船时将他拘捕，反先让学礼登上船。学礼看见船驶离码头，却发现家碧一直昏迷未醒，只靠仪器维持生命，家碧怀胎满月的时候，医生决定替她剖腹产子，世乐一直陪伴在侧予以鼓励，希璇看见世乐仍对家碧一往情深，决定离开香港。